Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERCC4Q92889 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms