Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRN4Q8WUT4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms