Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C17orf47Q8NEP4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms