Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SETD9Q8NE22 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SETD9Q8NE22 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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