Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM71DQ8N9W8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms