Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC155Q8N6L0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms