Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC71Q8IV32 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC71Q8IV32 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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