Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX20Q7Z614 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SNX20Q7Z614 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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