Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
STRCQ7RTU9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
STRCQ7RTU9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms