Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HECW1Q76N89 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms