Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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USP43Q70EL4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP43Q70EL4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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