Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms