Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUX4L9Q6RFH8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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