Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms