Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TTLL9Q3SXZ7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TTLL9Q3SXZ7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TTLL9Q3SXZ7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TTLL9Q3SXZ7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TTLL9Q3SXZ7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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