Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF8Q3BBV2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms