Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP6Q16828 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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