Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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RTN1Q16799 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTN1Q16799 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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