Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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