Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NTRK2Q16620 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NTRK2Q16620 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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