Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITSN1Q15811 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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