Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SYCP1Q15431 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SYCP1Q15431 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SYCP1Q15431 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SYCP1Q15431 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SYCP1Q15431 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SYCP1Q15431 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYCP1Q15431 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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