Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTPRRQ15256 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRRQ15256 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRRQ15256 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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