Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PCM1Q15154 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCM1Q15154 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms