Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PCOLCEQ15113 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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