Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
R3HDM1Q15032 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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