Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LAPTM4AQ15012 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms