Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMD6Q15008 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms