Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCAPHQ15003 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NCAPHQ15003 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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