Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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CHD4Q14839 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CHD4Q14839 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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