Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRIP12Q14669 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRIP12Q14669 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRIP12Q14669 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRIP12Q14669 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIP12Q14669 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIP12Q14669 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms