Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA9Q13797 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms