Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CUL4AQ13619 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CUL4AQ13619 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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