Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
EIF4EBP1Q13541 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms