Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3B2Q13367 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms