Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLN3Q13286 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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