Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RLFQ13129 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RLFQ13129 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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