Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GPS1Q13098 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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GPS1Q13098 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPS1Q13098 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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