Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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