Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMSAP2Q08AD1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAMSAP2Q08AD1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms