Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG1Q06432 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms