Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CALD1Q05682 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms