Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XPCQ01831 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XPCQ01831 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XPCQ01831 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XPCQ01831 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms