Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4GALNT1Q00973 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms