Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms