Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GTF2BQ00403 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms