Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAE1P78406 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAE1P78406 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAE1P78406 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAE1P78406 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAE1P78406 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAE1P78406 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAE1P78406 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RAE1P78406 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms