Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms