Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERVK_113P63132 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms