Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms